Le contrôle phytosanitaire est une des difficultés majeures de la culture des plantes succulentes. 
Les conditions de leur bon développement (températures élevées, hygrométrie limitée, substrats bien aérés...) conviennent ainsi parfaitement aux ravageurs susceptibles de les attaquer.
Depuis 1995 le Jardin Exotique a mis en oeuvre une politique de lutte phytosanitaire intégrée. Il s'agit de faire converger des moyens de contrôle sanitaire qui font appel à l'utilisation d'auxiliaires biologiques, à des techniques mécaniques non polluantes (lavages, tailles sélectives) mais aussi à l'utilisation de produits chimiques choisis en fonction de la nécessité de respecter les auxiliaires biologiques. Les traitements chimiques sont réduits au strict nécessaire, ils sont limités dans le temps et dans l'espace.